Vos Problémes de pliage CPU

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Vos Problémes de pliage CPU

Message par bob2a le Mar 23 Déc - 5:01

questions et réponses sur le pliage CPU et sur des problèmes rencontrés
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Problèmes avec le Update_Core sur client FAH version 7.4.4

Message par Ozone Sama le Sam 29 Avr - 20:46

Bonsoir, depuis quelques jours, mon client FAH (version 7.4.4) ne plie plus.
(Je suis en CPU seulement, sur un Windows 7 Pro. 64bits)
Il fait tourner un Update_Core sans que cela ne progresse (reste Ready à 0%),
et même un redémarrage de ma machine n'a rien changé.
Auriez-vous rencontré le même problème ? Avez-vous des solutions ?

Cordialement,
Ozone.

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Ozone Sama

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Re: Vos Problémes de pliage CPU

Message par Ozone Sama le Mar 2 Mai - 22:48

Bonsoir, j'ai trouvé une solution ( Lien Google Cache ),
en recherchant le message d'erreur "ERROR:110: Need version 0.0.13".

Il s'agit d'un projet mal configuré qui réclame un Core qui existe uniquement chez les
client Beta, mais ce projet est affecté aux clients Beta et non-Beta, donc insolvable
chez ces derniers.
Je vais effacer cette Work Unit et ça devrait remarcher.
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Ozone Sama

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Re: Vos Problémes de pliage CPU

Message par Ozone Sama le Mar 2 Mai - 22:53

Effectivement, ça marche ! Pffiou !
Bon, ça ne va pas aider mes statistiques,
mais c'est déjà mieux que rien.
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Re: Vos Problémes de pliage CPU

Message par bob2a le Lun 8 Mai - 7:13

Bonjour
désolé pas vu ton message
je suis sous GNU Linux (debian) j'ai eu quelques soucis aussi avec fah sous cpu.
sur le nombres de cores
un exemple j' affecte 7 coeurs sur 8 , ça ne fonctionne pas , avec 6 ça fonctionne
de plus en mono coeur c'est un projet différent , je dirai que l' idéal est d'avoir au moins un dual core (avec HT (donc 4 threads)
je fais tourner 10 threads sur un serveur et 6 threads chacun sur 2 Ryzen r7 1700
je laisse a 100% utilisation , mais je modifie le nombres de coeurs qu il utilise (configuration des slots)

exemple :
04:31:19:  <slot id='0' type='CPU'>
04:31:19:    <cpus v='6'/>

la machine :
17:15:14:        CPU: AMD Ryzen 7 1700X Eight-Core Processor
17:15:14:     CPU ID: AuthenticAMD Family 23 Model 1 Stepping 1
17:15:14:       CPUs: 16
17:15:14:     Memory: 15.67GiB
17:15:14:Free Memory: 15.30GiB
17:15:14:    Threads: POSIX_THREADS
17:15:14: OS Version: 4.9
17:15:14:Has Battery: false
17:15:14: On Battery: false
17:15:14: UTC Offset: 2
17:15:14:        PID: 1087
17:15:14:        CWD: /var/lib/fahclient
17:15:14:         OS: Linux 4.9.0-3-amd64 x86_64
17:15:14:    OS Arch: AMD64
17:15:14:       GPUs: 2
17:15:14:      GPU 0: NVIDIA:4 GM107 [GeForce GTX 750 Ti]
17:15:14:      GPU 1: NVIDIA:4 GM107 [GeForce GTX 750 Ti]

sur 16 threads , 2 sont utilisés par les gpu , 6 par le cpu (total 8 ) , avec le smt le cpu a 16 threads (donc 8 inactifs )
aprés il y a le problème si la machine reste allumé ou pas (dans mon cas oui , juste des reboots pour maintenance)


pense a entrer ton passkey , ça te donne un bonus de points (dans la configuration de FAH)

donc je suppose que pour ton problème tu a été affecté d un projet sur un coeur (pas smp ) , et j ai été confronté au meme problème que toi

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Re: Vos Problémes de pliage CPU

Message par bob2a le Ven 29 Sep - 21:39

Bonjour

mon nouveau bébé , sous debian Stretch (stable)

15:48:23:******************************* System ********************************
15:48:23:            CPU: AMD Ryzen Threadripper 1950X 16-Core Processor
15:48:23:         CPU ID: AuthenticAMD Family 23 Model 1 Stepping 1
15:48:23:           CPUs: 32
15:48:23:         Memory: 23.47GiB
15:48:23:    Free Memory: 22.94GiB
15:48:23:        Threads: POSIX_THREADS
15:48:23:     OS Version: 4.9
15:48:23:    Has Battery: false
15:48:23:     On Battery: false
15:48:23:     UTC Offset: 2
15:48:23:            PID: 1264
15:48:23:            CWD: /var/lib/fahclient
15:48:23:             OS: Linux 4.9.0-3-amd64 x86_64
15:48:23:        OS Arch: AMD64
15:48:23:           GPUs: 2
15:48:23:          GPU 0: Bus:9 Slot:0 Func:0 NVIDIA:4 GM107 [GeForce GTX 750 Ti] 1306
15:48:23:          GPU 1: Bus:65 Slot:0 Func:0 NVIDIA:4 GM107 [GeForce GTX 750 Ti] 1306
15:48:23:  CUDA Device 0: Platform:0 Device:0 Bus:9 Slot:0 Compute:5.0 Driver:8.0
15:48:23:  CUDA Device 1: Platform:0 Device:1 Bus:65 Slot:0 Compute:5.0 Driver:8.0
15:48:23:OpenCL Device 0: Platform:0 Device:0 Bus:9 Slot:0 Compute:1.2 Driver:375.66
15:48:23:OpenCL Device 1: Platform:0 Device:1 Bus:65 Slot:0 Compute:1.2 Driver:375.66

quelques soucis avec debian testing ou unstable , a priori version trop récente , fah me fait des erreurs 102 pour le pliage CPU
pour l'instant je tourne a 12 threads maximum + 2 threads pour les gpu , phase de mise au point ............. (testé 32 threads ça dépote  Shocked   )
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Re: Vos Problémes de pliage CPU

Message par 6rill2000 le Mar 28 Nov - 11:43

Threadripper 1950X, tu t'es fait vraiment plaisir là Shocked Very Happy

Je me demandais comment tu faisais pour avoir une production pareille, maintenant je sais Wink

Merci à toi de nous faire profiter d'un tel matériel !

6rill2000

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Re: Vos Problémes de pliage CPU

Message par bob2a le Jeu 30 Nov - 5:55

Bonjour
j'ai testé le flag bigadv pour les wu's sur cpu

04:13:15:  <!-- Folding Slots -->
04:13:15:  <slot id='0' type='CPU'>
04:13:15:    <client-type v='bigadv'/>
04:13:15:  </slot>
04:13:15:  <slot id='1' type='GPU'/>
04:13:15:</config>
04:13:26:WU01:FS01:0x21:Completed 4437500 out of 6250000 steps (71%)
04:14:01:WU00:FS00:Connecting to 171.67.108.45:8080
04:14:02:WU00:FS00:Assigned to work server 155.247.166.220
04:14:03:WU00:FS00:Requesting new work unit for slot 00: READY cpu:31 from 155.247.166.220
04:14:03:WU00:FS00:Connecting to 155.247.166.220:8080
04:14:04:WU00:FS00:Downloading 895.66KiB
04:14:06:WU00:FS00:Download complete
04:14:06:WU00:FS00:Received Unit: id:00 state:DOWNLOAD error:NO_ERROR project:13797 run:2 clone:0 gen:12 core:0xa7 unit:0x0000000d0002894c5a13690811c11326
04:14:06:WU00:FS00:Starting
04:14:06:WU00:FS00:Running FahCore: /usr/bin/FAHCoreWrapper /var/lib/fahclient/cores/fahwebx.stanford.edu/cores/Linux/AMD64/AVX/Core_a7.fah/FahCore_a7 -dir 00 -suffix 01 -version 704 -lifeline 1278 -checkpoint 15 -np 31
04:14:06:WU00:FS00:Started FahCore on PID 3722
04:14:06:WU00:FS00:Core PID:3726
04:14:06:WU00:FS00:FahCore 0xa7 started
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:*********************** Log Started 2017-11-30T04:14:06Z ***********************
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:************************** Gromacs Folding@home Core ***************************
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Type: 0xa7
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Core: Gromacs
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:    Website: http://folding.stanford.edu/
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:  Copyright: (c) 2009-2016 Stanford University
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:     Author: Joseph Coffland <joseph@cauldrondevelopment.com>
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Args: -dir 00 -suffix 01 -version 704 -lifeline 3722 -checkpoint 15 -np
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:             31
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:     Config: <none>
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:************************************ Build *************************************
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:    Version: 0.0.16
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Date: Oct 31 2017
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Time: 19:24:09
04:14:07:WU00:FS00:0xa7: Repository: Git
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:   Revision: 2f0a8a3d0b0698be48154fe99a0216f289060932
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:     Branch: master
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:   Compiler: GNU 4.9.2
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:    Options: -std=gnu++98 -O3 -funroll-loops
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:   Platform: linux2 4.9.0-1-amd64
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Bits: 64
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       Mode: Release
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       SIMD: avx_256
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:************************************ System ************************************
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:        CPU: AMD Ryzen Threadripper 1950X 16-Core Processor
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:     CPU ID: AuthenticAMD Family 23 Model 1 Stepping 1
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:       CPUs: 32
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:     Memory: 31.35GiB
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Free Memory: 28.61GiB
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:    Threads: POSIX_THREADS
04:14:07:WU00:FS00:0xa7: OS Version: 4.13
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Has Battery: false
04:14:07:WU00:FS00:0xa7: On Battery: false
04:14:07:WU00:FS00:0xa7: UTC Offset: 1
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:        PID: 3726
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:        CWD: /var/lib/fahclient/work
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:         OS: Linux 4.13.0-1-amd64 x86_64
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:    OS Arch: AMD64
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:********************************************************************************
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Project: 13797 (Run 2, Clone 0, Gen 12)
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Unit: 0x0000000d0002894c5a13690811c11326
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Reading tar file core.xml
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Reading tar file frame12.tpr
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Digital signatures verified
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Reducing thread count from 31 to 30 to avoid domain decomposition by a prime number > 3
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Calling: mdrun -s frame12.tpr -o frame12.trr -cpt 15 -nt 30
04:14:07:WU00:FS00:0xa7:Steps: first=30000000 total=2500000
04:14:08:WU00:FS00:0xa7:Completed 1 out of 2500000 steps (0%)

la première fois que j'arrive a avoir ce type de wu , il faut il me semble 24 cores minimum
donc meme le threadripper est limite (16) , le ppd est de 200000 environ
le cpu est compatible  => SIMD: avx_256  (pas en 512)  il me semble pour les instructions avx

nota : la wu bascule de 31 threads a 30 pour la compatibilité => Reducing thread count from 31 to 30 to avoid domain decomposition by a prime number > 3
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